在開始一個新成立的水族館，廢品可以快速累積到有毒水平。引進魚類，植物和食物，你的水族館開始了一個自然的過程稱為“生化騎自行車”，這是氮循環的例證。
大自然提供了許多類型的細菌，在氧氣存在下進行氧化氨硝酸鹽亞硝酸鹽，並最終在這個過程稱為硝化作用。首先，細菌定居文石（礁沙），他們成長為殖民地，最終形成生物膜。海洋硝化細菌在生物膜氨氧化成亞硝酸鹽。然後，其他細菌物種進一步氧化為硝酸鹽亞硝酸鹽。硝酸鹽是沒有利用植物去除其他細菌在沒有氧氣（厭氧環境中發現在較低水平的沉積物）在這個過程被稱為反硝化作用。這些細菌是無害的，而且相當豐富的性質。然而，三個條件都需要這個過程中發生：
